Отправлено: 08.06.14 12:05. Заголовок: Снипы формата YP и Y

Что нужно сделать, чтобы снип YP449 и Y934 появился в заказах в FTDNA. Эти снипы интересны будут прежде всего для представителей туранских подветвей субклада Z2123.

YP449 - характерен для карачаевских Z2123, а Y934 встречается среди башкир из усуньской подветви субклада Z2123.

YP и Y форматы введены yfull.com.

Насколько мне известно праймеры снипов YP и Y - делает форумчанин Центурион с молгена.

Синонимы этих снипов в FTDNA другие.

К примеру:
Открываем дерево http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpR.html

Там снип Z94 имеет ещё одно название F3105, т.е. два разных исследователя правильно подобрали праймеры этой одной мутации.

Z94 - делала команда Грегора Магуна.

А название F3105 ввел Ли Чжин из Шанхая.

Для того чтобы снипы форматы yfull.com появились для заказа в FTDNA, необходимо правильно указать их праймеры. А этим занимается форумчанин Центурион с молгена. Центурион высылает праймеры, а остальные - если хотят чтобы эти снипы появились для заказа в FTDNA - просто заваливают их письмами с просьбой ввести эти снипы.

Попросил FTDNA ввести снипы Y934 и Y449 для заказа. Кто хочет - присоединяйтесь.
Я писал на helpdesk@ftdna.com

 Отправлено: 08.06.14 12:37. Заголовок: Пока не обнаружил ка..

Пока не обнаружил какому именно фтднашному снипу, компания yfull.com дала другое имя - YP449.

В FTDNA у снипов YР449 как и У934 - другие названия.

Как по другому называются снипы У934 и УР449 - в ФТДНА - пока не знаю.

 Отправлено: 08.06.14 12:49. Заголовок: Попросил FTDNA ввес..

цитата:

Попросил FTDNA ввести снипы Y934 и Y449 для заказа. Кто хочет - присоединяйтесь. Я писал на helpdesk@ftdna.com

Забыл добавить. ФТДНА не любят когда им пишут длинные письма, тем более иностранцы .

Я писал такое короткое письмо:

цитата:

Good day! Please enter your orders in SNPs YP449 and Y934. Look at in this tree of Y-DNA http://yfull.com/tree/R-Z2123/ Sincerely.

Т.е. не забывайте указывать с какой именно компании взять формат снипа.
На Родстве.ру продублирую эту тему.

 Отправлено: 08.06.14 12:58. Заголовок: Cау бол, Amigo!..

Cау бол, Amigo!

Чтобы выяснить насколько близок к карачаево-балкарской ветви z2123 YP449, западноевропейцы уговорил

13091 Letten German заказать снип YP449, но оказалось, что снип еще не доступен для заказа.

 Отправлено: 08.06.14 13:11. Заголовок: Желательно, но не об..

Желательно, но не обязательно ещё - одну тему письма указать, это позволит ФТДНА сгруппировать эти письма.

У меня тема письма:
Please enter your orders in SNPs YP449 and Y934

 Отправлено: 08.06.14 13:21. Заголовок: Думаю, пока не надо ..

Думаю, пока не надо спешить c просьбами к FTDNA. Например, почему YP449, а не YP455?

Какая у нас ситуация на сегодня? Мы имеем 17 снипов (с YP449 по YP465), присутствующие у карачаевцев и отсутствующие у протестированных арабо-индийцев и Каримова. Но, как известно, по СТР они далеки от наших.

Т.е. получается "наши" снипы расположены в интервале 4200-1800 лет назад, и неизвестно какой из них старше-моложе.

Чтобы узнать положение этих снипов, надо протестировать кого-нибудь из кластера F3 (близкий к нам на филоген.построениях) на эти снипы.

В FTDNA это сделать не получится: они не будут вводить сразу 17 снипов для заказа, да и дорого это выйдет. Легче BigY заказать.

Я пока вижу два варианта:

1) Подождать скидок на BigY и уговорить кого-нибудь из кластера F3. Но я не знаю будут ли в этом году скидки, и вообще не уверен, что кто-то захочет заказать этот продукт в виду немалой цены. Полгода назад я обращался к двоим, но они не смогли.

2) Проверить кого-нибудь из этого кластера на наши снипы в Yseq.net . Цена меньше чем в ФТДНА, да и проверяют они любой снип на выбор. Но, в целом, тоже недешево выйдет.

 Отправлено: 08.06.14 13:25. Заголовок: Да и еще давайте дож..

Да и еще давайте дождемся результатов Акбаева.

 Отправлено: 08.06.14 13:30. Заголовок: Amigo пишет: Good d..

Amigo пишет:

цитата:

Good day! Please enter your orders in SNPs YP449 and Y934. Look at in this tree of Y-DNA http://yfull.com/tree/R-Z2123/ Sincerely.

Этой информации недостаточно - аббревиатура им ничего не скажет. Необходима следующая информация о снипе (пример):

name: Y47
Build 37 position: 18060735
Ancestral allele: T
Derived allele: C
Note: downstream of Z2123

 Отправлено: 08.06.14 13:39. Заголовок: Кластер F3: 13091 B..

Кластер F3:

13091 Bernard Letten(Beneweg),b. 1738, Lembeck, Germany Germany
221867 1740, Southern Crimea Russian Federation
297806 Золотов Василий Федорович, 27.12.1880 Russian Federation
B5766 Teunis Dircxs van Schalckwijck Netherlands
B2586 James Johnson, b. abt 1814 and d. abt 1858 Unknown Origin
217168 Thomas Seymour (d. 1766) Ireland
103319 Thomas Wyatt abt 1700 - abt 1761 Unknown Origin
307961 д.Н.Чекурское, Дрожжановск. р., РТ, Tatar Russian Federation

 Отправлено: 08.06.14 13:40. Заголовок: Эсен пишет: Да и ещ..

Эсен пишет:

цитата:

Да и еще давайте дождемся результатов Акбаева.

Хорошо, Акбаевский Big-Y может и отсеет некоторые снипы.

 Отправлено: 08.06.14 13:41. Заголовок: Павел пишет: Зачем ..

Павел пишет:

цитата:

Зачем нужна путаница с форматами? Надо ориентироваться на фтдна, если чего-то там еще нет, то скоро появится. Главное - направлять людей делать анализ в правильную лабораторию, а не в китайско молгеновскую конторку, тогда и проблем с форматами не будет.

В том то и дело, что снипы Y934 и УР449 уже есть в ФТДНА, но как они там называются - неизвестно.

Для этого необходимо знать праймеры. А праймеры по снипам YP449 и Y934 у yfull.com

Если ФТДНА люди завалят просьбами - то ФТДНА свяжутся с yfull.com - и yfull.com вышлют в FTDNA праймеры снипов YP449 и Y934.

Чем больше люди будут просить - тем больше вероятность что ФТДНА введут снипы YP449 и УР934 в продажу, либо - укажут что является синонимами этих снипов у них в ФТДНА.

 Отправлено: 08.06.14 13:47. Заголовок: Эсен пишет: Этой ин..

Эсен пишет:

цитата:

Этой информации недостаточно - аббревиатура им ничего не скажет. Необходима следующая информация о снипе (пример): name: Y47 Build 37 position: 18060735 Ancestral allele: T Derived allele: C Note: downstream of Z2123

Спасибо очень важное дополнение!

Но разве не сам yfull.com предоставляет ФТДНА эту информацию?

 Отправлено: 08.06.14 13:53. Заголовок: Эсен пишет: Думаю, ..

Эсен пишет:

цитата:

Думаю, пока не надо спешить c просьбами к FTDNA. Например, почему YP449, а не YP455?

Но yfull выделили именно снип YP449. Поэтому. ФТДНА ориентируется на древо.

Почему Yfull выделили именно этот снип.

Там на сайте yfull.com указаны два карачаевских гаплотипа. Насколько мне известно выводят только общие снипы.

Следовательно, возможно, у обоих карачаевцев этот снип УР449 - есть. Но. Неизвестен возраст этого снипа Y449. Возможно УР449 такой же древний как и Y934. У снипа УР934 возраст по подсчетам И.Рожанского 4200 лет.

 Отправлено: 08.06.14 13:53. Заголовок: Ветка YP 449 есть, ..

Ветка YP 449 есть, имени нет
нехорошо.

 Отправлено: 08.06.14 14:04. Заголовок: Atly пишет: Ветка Y..

Atly пишет:

цитата:

Ветка YP 449 есть, имени нет нехорошо.

Под снипом УР449 могут оказаться не только карачаевцы. Возраст снипа пока неизвестен, география распространения тоже. Неизвестно присутствует ли этот снип скажем у чехов или астурийцев, или ещё у каких-либо тюркоязычных и других народов.

 Отправлено: 08.06.14 14:20. Заголовок: Эсен пишет: Кластер..

Эсен пишет:

цитата:

Кластер F3: 13091 Bernard Letten(Beneweg),b. 1738, Lembeck, Germany Germany 221867 1740, Southern Crimea Russian Federation 297806 Золотов Василий Федорович, 27.12.1880 Russian Federation B5766 Teunis Dircxs van Schalckwijck Netherlands B2586 James Johnson, b. abt 1814 and d. abt 1858 Unknown Origin 217168 Thomas Seymour (d. 1766) Ireland 103319 Thomas Wyatt abt 1700 - abt 1761 Unknown Origin 307961 д.Н.Чекурское, Дрожжановск. р., РТ, Tatar Russian Federation

Не совсем понятно почему тогда в пректе R1a http://www.familytreedna.com/public/R1a/default.aspx?section=yresults

кластер F3 9. ...>Z93>Z94>Z2124>Z2125>Z2123>YP449(?) (Big Y needed) YP449 под вопросом.

 Отправлено: 08.06.14 14:26. Заголовок: Amigo пишет: Под сн..

Amigo пишет:

цитата:

Под снипом УР449 могут оказаться не только карачаевцы. Возраст снипа пока неизвестен, география распространения тоже. Неизвестно присутствует ли этот снип скажем у чехов или астурийцев, или ещё у каких-либо тюркоязычных и других народов.

Дальше в лес больше дров.

 Отправлено: 08.06.14 14:28. Заголовок: Atly пишет: у класт..

Atly пишет:

цитата:

у кластера F3 9. ...>Z93>Z94>Z2124>Z2125>Z2123>YP449(?) (Big Y needed)

Вероятнее всего админы проекта R1a на ФТДНА, из 17 карачаевских снипов - выбрали именно YP449 - как наиболее древний, и который может оказаться не только у карачаевцев.

Но лучше такие вопросы задавать Семарглу на молгене. Ответит или нет - не знаю.

 Отправлено: 08.06.14 14:32. Заголовок: Atly пишет: Дальше ..

Atly пишет:

цитата:

Дальше в лес больше дров.

Классификацию в проекте R1a на ФТДНА вводят ихние админы, лучше у них уточнить. Спроси у Семаргла на молгене - почему так сделали, он в курсе. А я только предположил по каким причинам, но точно не знаю - почему не написали карачаевцы - там где указан YP449 на картинке.

 Отправлено: 08.06.14 15:40. Заголовок: Мне должны сделать п..

Мне должны сделать полный сиквенс... Может это что-нибудь даст...

 Отправлено: 08.06.14 15:42. Заголовок: Atly пишет: Ветка Y..

Atly пишет:

цитата:

Ветка YP 449 есть, имени нет нехорошо.

Пришёл ответ Игоря Рожанского, одного из админов проекта R1a на FTDNA, почему карачаевцев не указали под снипом УР449 на схеме.

Игорь пишет:

цитата:

Есть некоторая вероятность, что окажется положительным у евреев из небольшой молодой веточки. На 111 маркерах они как будто бы группируются с единственным пока карачаевцем, сделавшим такой тест.

Т.е. другими словами есть вероятность почему пока под снипом не указали надпись - карачаевцы, т.к. могут оказаться под этим снипом и представители других народов.

 Отправлено: 08.06.14 19:55. Заголовок: Amigo пишет: Т.е. д..

Amigo пишет:

цитата:

Т.е. другими словами есть вероятность почему пока под снипом не указали надпись - карачаевцы, т.к. могут оказаться под этим снипом и представители других народов.

То есть, возможно, что какой-то карачаевец оказался родоначальником небольшой веточки у евреев.)))

 Отправлено: 08.06.14 20:01. Заголовок: Albert пишет: То ес..

Albert пишет:

цитата:

То есть, возможно, что какой-то карачаевец оказался родоначальником небольшой веточки у евреев.)))

Ага. Или алан.

 Отправлено: 08.06.14 20:05. Заголовок: Amigo пишет: Ага. И..

Amigo пишет:

цитата:

Ага. Или алан.

Ну да, всё зависит от возраста веточки. Если алан, то всё понятно становится.

 Отправлено: 08.06.14 20:42. Заголовок: Albert пишет: Мне д..

Albert пишет:

цитата:

Мне должны сделать полный сиквенс... Может это что-нибудь даст...

Да когда уже ?Все заждались.

 Отправлено: 08.06.14 21:03. Заголовок: Albert пишет: То ес..

Albert пишет:

цитата:

То есть, возможно, что какой-то карачаевец оказался родоначальником небольшой веточки у евреев

Вот дерево на 111 маркерах. У еврейской веточки тот самый DYS463=25, видимо поэтому И. Рожанский выдвинул предположение о возможной близости их к нашей ветке. По STR ближе Астуриец, у него тоже DYS463=25

 Отправлено: 08.06.14 21:24. Заголовок: Источник пишет: Да ..

Источник пишет:

цитата:

Да когда уже ?Все заждались.

Дело в том, что в первый раз конверт с моим китом был вскрыт и он не попал в лабораторию. Я отправил во второй раз. Вроде бы, в этот раз всё должно дойти.

 Отправлено: 09.06.14 00:55. Заголовок: Amigo пишет: Для эт..

Amigo пишет:

цитата:

Для этого необходимо знать праймеры. А праймеры по снипам YP449 и Y934 у yfull.com Если ФТДНА люди завалят просьбами - то ФТДНА свяжутся с yfull.com - и yfull.com вышлют в FTDNA праймеры снипов YP449 и Y934.

Праймеры – это по части микробиологов. Yfull выдает информацию о позиции снипа, чтобы ученые в лаборатории могли подобрать праймеры.

цитата:

Спасибо очень важное дополнение! Но разве не сам yfull.com предоставляет ФТДНА эту информацию?

Не за что.

Yfull предоставляет ее своим клиентам, а мы уже направляем в FTDNA. "Спасение утопающих - дело рук самих утопающих"

Вот инфа по YP449, к примеру:

ChrY position: 6796744 (+strand)
Reads: 75
Position data: 75G
Weight for G: 1.0
Probability of error: 0.0 (0<->1)
Consensus allele: G
Reference allele: C

цитата:

Но yfull выделили именно снип YP449. Поэтому. ФТДНА ориентируется на древо. Почему Yfull выделили именно этот снип.

Он просто первый по нумерации

цитата:

Следовательно, возможно, у обоих карачаевцев этот снип УР449 - есть.

Так он и есть у обоих (у Атлы и Темирболата). Как и остальные 16 снипов с YP450 по YP465.
Кстати, эти снипы нашли админы-поляки из R1a-проекта (YP… - их аббревиатура). Но они их нашли по тем данным, что есть в личных кабинетах, без анализа БАМов. Скорее всего, общих снипов там еще больше (БАМ-файл Темирболата пока обрабатывается в Yfull).

цитата:

Возможно УР449 такой же древний как и Y934.

Я про это и пишу. Возраст пока не ясен.

цитата:

У снипа Y934 возраст по подсчетам И.Рожанского 4200 лет.

Поэтому не вижу особого смысла в его заказе для тех, у кого он не проверен. Почти ровесник Z2123.

Просмотрел сейчас Rodstvo. В этом моменте ты неправильно понял Игоря:

цитата:

Так вот, судя по информации с гаплогруппного проекта, снип Y934 найден у группы индийцев и арабов с очень характерной меткой DYS643=8. Их общий предок с башкирской ветвью с DYS425=10 уходит почти к самому корню всего субклада Z2123, не менее чем на 4200 лет назад.

Он не про Тулсиана писал, а про ту самую индо-арабскую ветвь, которую нам одно время прочили в родственники. Ты должен помнить эту историю).
Один из них также заказывал BigY (кит М6698), по результатам которого стало ясно, что он Y934+.

 Отправлено: 09.06.14 01:02. Заголовок: Ок Эсен, спасибо! ht..

Ок Эсен, спасибо!

 Отправлено: 09.06.14 01:04. Заголовок: Atly пишет: Не совс..

Atly пишет:

цитата:

Не совсем понятно почему тогда в пректе R1a http://www.familytreedna.com/public/R1a/default.aspx?section=yresults кластер F3 9. ...>Z93>Z94>Z2124>Z2125>Z2123>YP449(?) (Big Y needed) YP449 под вопросом.

Лучше б оставили как было. С таким же успехом можно бы было поставить YP450(?).

К тому же YP449 недоступен для заказа, зачем тогда народ грузить?

Albert пишет:

цитата:

Мне должны сделать полный сиквенс... Может это что-нибудь даст...

Конечно, даст, т.к. он охватывает то, что не охватил BigY.

 Отправлено: 20.02.17 19:35. Заголовок: Компания Yfull.com -..

Компания Yfull.com - типичные пираты.

Обратил внимание, что Владимир Таганкин, он же Семаргл даёт свои литеры уже открытым снипам - и присваивает им свою серию или под литерами Y или YP.

К примеру снип SUR86, открытый нами в 2014-м году Таганкин обозначил в 2016-м своим названием - Y20746.

Ну что ж возьмём пример с Таганкина и отныне открытые им снипы к примеру Y2632 будем называть своими литерами.

Y2632 у нас SUR250.