Отправлено: 27.08.14 23:17. Заголовок: Family Finder. Балкарцы и карачаевцы

В этой теме хотел бы ознакомить участников и читателей форума с результатами теста Family Finder.

Данный тест оценивает совпадения на определенных участках аутосомных хромосом.

Из школьного курса биологии мы знаем, что у человека 46 хромосом. По 23 хромосомы он получает от родителей. Эти хромосомы соединяются в 23 пары.
Одна из этих пар состоит из половых хромосом: две X-хромосомы у женщин, X-хромосома + Y-хромосома у мужчин.

Так вот FF анализирует определенные участки остальных 22-ух пар хромосом.

Люди, у которых даже относительно небольшие участки полностью совпадают с вашими - наверняка унаследовали их от общих с вами предков и являются вашими родственниками. Но вот насколько дальними, зависит от размеров совпадающих участков.

Данные участки обозначаются как УПС («участок половинного совпадения»). Встречается также такое обозначение как "совпадающий блок".Эти участки измеряются в сантиморганах (сМ).

У двух людей может быть много пересекающихся участков, но если длина самого большого из УПСов составляет менее 7 сМ, то о более-менее близком родстве говорить не приходится.

Большое количество коротких (<7 сМ) пересекающихся участков с другими людьми показывает нам ареал, где живут популяции с похожими генами, унаследованными от более далёких общих предков. Речь идет о т.н. аутосомном фоне. Например, у протестированного карачаевца в приближенцах обязательно выдаст пару-тройку других карачаевцев и представителей соседних народов.

 Отправлено: 07.10.14 19:15. Заголовок: Эсен пишет: Просто ..

Эсен пишет:

цитата:

Просто нет крупного совпадающего участка с Тоторкуловым. Наборот, я бы удивился, если бы "все были в сборе" в качестве приближенцев Гергокова.

Значит, думаю, тут ситуация такая: родство у них по балкарской линии - у Хасанова и Семенова должны быть балкарцы в роду. То, что у Хасанова есть балкарцы, мы знаем. И Моллаев вписывается в балкарскую группу, зря он думал, что не вписывается. У Тоторкулова нет балкарской примеси, потому он и не попал сюда. Скорее всего, так.

 Отправлено: 07.10.14 21:35. Заголовок: Эсен пишет: Гергоко..

Эсен пишет:

цитата:

Гергоков Full Name Shared cM Longest Block Zhangurazov 66,28 14,83 Gilaystanov 42,65 11,41 Semenov 49,64 10,64 Mollaev 58,78 9,26 Khasanov 70,41 8,92 Murachaev 47,33 7,92 Karsanov 43,09 10,89 Mulkoev 24,42 8,22 Čorak 22,96 10,34 Vukovic 29,33 8,63 Page 21,58 8,26 Shostak 22,92 8,17 Tune 26,62 8,11 Gullett 31,47 8,07 Только Тоторкулова не хватает)

Получается самый близкий ко мне Ханапи, потом Жангуразов? Или я что-то не так поняла?

 Отправлено: 07.10.14 21:55. Заголовок: Гергокова Лейля Что..

Гергокова Лейля
Что тебе близки и мне близки, но как с Тоторкуловы тебя у меня в списке нет.
Gilaystanov 42,65 11,41
Semenov 49,64 10,64
Khasanov 70,41 8,92

 Отправлено: 07.10.14 21:58. Заголовок: Гергокова Лейля Инт..

Гергокова Лейля
Интересно будет взглянуть на Admixture (смесь от разных компонент, есть на gedmatch.com).

К слову джамагъат, на gedmatch загружены киты ископаемых анализов из разных археологических находок, в том числе из Мальты мальчика, если не ошибаюсь.

 Отправлено: 07.10.14 22:31. Заголовок: Albert пишет: Значи..

Albert пишет:

цитата:

Значит, думаю, тут ситуация такая: родство у них по балкарской линии - у Хасанова и Семенова должны быть балкарцы в роду. То, что у Хасанова есть балкарцы, мы знаем. И Моллаев вписывается в балкарскую группу, зря он думал, что не вписывается. У Тоторкулова нет балкарской примеси, потому он и не попал сюда. Скорее всего, так.

У Тоторкулова 3 балкарца в приближенцах

Эсен пишет:

цитата:

Тоторкулов Full Name Shared cM Longest Block Khasanov 176,85 17,09 Semenov 89,98 17,83 Mollaev 56,07 15,85 Murachaev 60,97 10,54 Zhangurazov 35,30 10,49 Berezov 32,90 10,66 Ketsbaia 26,97 10,67 Dishni 28,78 10,44 LE JEUNE 37,74 10,05 Syundyukov 22,58 8,71 HARSHMAN 20,46 8,17 Ken Alyta 21,35 7,83

Думаю, балкаро-карачаевские пересечения указывает не сколько на примеси, а сколько на общность происхождения. Я выше приводил информацию, что общие УПСы могут идти с более ранних времен.

 Отправлено: 07.10.14 22:33. Заголовок: Ходжа

а как можно узнать информацию о своих примесях, я правильно сформулировал вопрос?

 Отправлено: 07.10.14 22:39. Заголовок: Гергокова Лейля пише..

Гергокова Лейля пишет:

цитата:

Получается самый близкий ко мне Ханапи, потом Жангуразов? Или я что-то не так поняла?

Общая длина совпадающих блоков почти одинаковая, а вот длина самого крупного блока у Жангуразова больше в 2 раза.

Так что Жангуразов ближе по идее.


Turk пишет:

цитата:

Интересно будет взглянуть на Admixture (смесь от разных компонент, есть на gedmatch.com).

Все наши загружены туда. F+номер кита

Гергоковские файлы еще в обработке, но через калькуляторы можно уже "прогнать".

 Отправлено: 07.10.14 22:45. Заголовок: Эсен А в проекте ви..

Эсен
А в проекте видно список всех FF?

В одной турецкой группе, ведущей проект Anadolu DNA.
FTDNA Anadolu Genetik Projesi Tartışma Grubu интересуются карачаевскими и балкарскими аутосомами, в этой группе я тоже админ, в проекте есть несколько турецких карачаевцев, они и так в КБ проекте тоже есть, народу интересно Admixture результаты кавказских тюрок, более того они довольно сильный интерес делают на аутосомы, чем Y-dna в отличии от нас тут, строят графики.

Если я дам ваши киты номера из Gedmatch против будете?

 Отправлено: 07.10.14 22:52. Заголовок: Turk пишет: Гергоко..

Turk пишет:

цитата:

Гергокова Лейля Что тебе близки и мне близки, но как с Тоторкуловы тебя у меня в списке нет. Gilaystanov 42,65 11,41 Semenov 49,64 10,64 Khasanov 70,41 8,92

У меня в роду почти все Холамские, только одна прапрабабушка Малкъарская.

 Отправлено: 07.10.14 22:59. Заголовок: Эсен пишет: Общая д..

Эсен пишет:

цитата:

Общая длина совпадающих блоков почти одинаковая, а вот длина самого крупного блока у Жангуразова больше в 2 раза. Так что Жангуразов ближе по идее.

До Малкъара ведь рукой подать.

 Отправлено: 07.10.14 22:59. Заголовок: Собрал список, вроде..

Собрал список, вроде бы все:

Khasanov - karaçaylı G2a3b F246812
Semenov - karaçaylı G2a1 F210731
Mollaev - balkar G2a1 F315539
Murachaev - balkar R1b F315546
Zhangurazov - balkar R1b F277357
Gilaystanov - balkar R1b F311492
Totorkulov - karaçaylı T1a2 F297984
Gergokov - balkar R1a F277523

 Отправлено: 08.10.14 00:04. Заголовок: В Холамских селах из..

В Холамских селах из Малкъара было несколько семей: Бозиевы 5 семей, Базоевы 1 семья, Муртазовы 1 семья, Кужоновы 1 семья... Ну а если принять холамских Атабиевых и малкъарских как один род, то пол-Холама малкъарский получится)

Кстати, надо бы Атабиевых протестировать.

 Отправлено: 08.10.14 00:30. Заголовок: Biberd пишет: В Хол..

Biberd пишет:

цитата:

В Холамских селах из Малкъара было несколько семей: Бозиевы 5 семей, Базоевы 1 семья, Муртазовы 1 семья, Кужоновы 1 семья... Ну а если принять холамских Атабиевых и малкъарских как один род, то пол-Холама малкъарский получится)

в более ранних документах Холам и Бизинги значаться не как отдельные области а как села. Очевидно, с учетом того что до сер. Малкар занимал не только ущелье но и часть предгория, Холам и Бизенги были спорной частью между Чегемом и Малкаром

 Отправлено: 08.10.14 01:02. Заголовок: Turk пишет: Собрал ..

Turk пишет:

цитата:

Собрал список, вроде бы все: Khasanov - karaçaylı G2a3b F246812 Semenov - karaçaylı G2a1 F210731 Mollaev - balkar G2a1 F315539 Murachaev - balkar R1b F315546 Zhangurazov - balkar R1b F277357 Gilaystanov - balkar R1b F311492 Totorkulov - karaçaylı T1a2 F297984 Gergokov - balkar R1a F277523

Да, это все с FF. Кто-то был из 23andMe, но я не помню кто.

Надо бы еще пару карачаевцев на аутосомный тест... Будет 5 на 5)


Biberd пишет:

цитата:

В Холамских селах из Малкъара было несколько семей: Бозиевы 5 семей, Базоевы 1 семья, Муртазовы 1 семья, Кужоновы 1 семья... Ну а если принять холамских Атабиевых и малкъарских как один род, то пол-Холама малкъарский получится) Кстати, надо бы Атабиевых протестировать.

Мне кажется, не совпадут))

А вообще, с учетом 7 уже протестированных холамцев, по-моему, там немного осталось не охваченных фамилий.

 Отправлено: 08.10.14 01:06. Заголовок: Малкаровы есть безен..

Малкаровы есть безенгийские?

 Отправлено: 08.10.14 01:06. Заголовок: Эсен пишет: Надо бы..

Эсен пишет:

цитата:

Надо бы еще пару карачаевцев на аутосомный тест... Будет 5 на 5)

Кстати, может, Сапар захочет? Я с ним завтра поговорю. Сколько это будет стоить?

 Отправлено: 08.10.14 01:17. Заголовок: 99..

99

 Отправлено: 08.10.14 01:21. Заголовок: $?..

$?

 Отправлено: 08.10.14 01:50. Заголовок: Albert пишет: $? он..

Albert пишет:

цитата:

$?

они самые

 Отправлено: 08.10.14 12:09. Заголовок: Аутосомные данные из..

Аутосомные данные из ископаемых ДНК:
F999918 (Loschbour)
F999917 (Motala-12)
F999916 (Linearbandkeramik)
F999915 (La Braña-Arintero)
F999914 (Malta MA-1)
F999913 (Clovis Anzick-1)

 Отправлено: 08.10.14 16:39. Заголовок: Turk пишет: F999914..

Turk пишет:

цитата:

F999914 (Malta MA-1)

Не знаю, насколько корректно сравнение археологических данных мальчика из Мальта, который R* с современными популяциями, но интересны результаты по разным проектам. На первом месте чуваши, затем фино-угры, затем русские, закралось подозрение, что фино-угры будут ближе, анализ через проект MLDP по заявлениям на сегодняшний день с наибольшим числом представителей от разных народов показал большую близость к тубалары и фино-уграм (относительную само собой 20 000 лет дальность весьма огромна), хмм что и требовалась ожидать)), само собой география его расположения соответствующая.

Dodecad K12b Oracle results:
The GEDmatch version of Oracle may give slightly different results from Dienekes version. The GEDmatch version uses FST weighting in its calculations.

Kit F999914

Admix Results (sorted):

# Population Percent
1 North_European 47.46
2 Gedrosia 24.39
3 South_Asian 14.36
4 Siberian 13.55
5 Sub_Saharan 0.24

Single Population Sharing:

# Population (source) Distance
1 Chuvashs (Behar) 26.54
2 Mordovians (Yunusbayev) 32.07
3 Russian (HGDP) 33.06
4 Tajiks (Yunusbayev) 34.96
5 Russian (Dodecad) 36.33
6 Russian_B (Behar) 37.57
7 Mixed_Slav (Dodecad) 37.69
8 FIN30 (1000Genomes) 37.77
9 Ukranians (Yunusbayev) 38.31
10 Finnish (Dodecad) 39.33
11 Polish (Dodecad) 39.48
12 Hungarians (Behar) 39.54
13 Belorussian (Behar) 39.91
14 Swedish (Dodecad) 40.38
15 German (Dodecad) 40.86
16 Pathan (HGDP) 41.02
17 Lithuanian (Dodecad) 41.33
18 Burusho (HGDP) 41.41
19 Uzbeks (Behar) 41.64
20 Jatt (Dodecad) 41.72

 Отправлено: 08.10.14 16:46. Заголовок: Kit Num: F999914 Thr..

Kit Num: F999914
Threshold of components set to 1.000
Threshold of method set to 0.25%
Personal data has been read. 20 approximations mode.
Gedmatch.Com

MDLP K23b 4-Ancestors Oracle

This program is based on 4-Ancestors Oracle Version 0.96 by Alexandr Burnashev.
Questions about results should be sent to him at: Alexandr.Burnashev@gmail.com
Original concept proposed by Sergey Kozlov.
Many thanks to Alexandr for helping us get this web version developed.

MDLP K23b Oracle Rev 2014 Sep 16

Admix Results (sorted):

# Population Percent
1 Ancestral_Altaic 83.13
2 Amerindian 7.34
3 South_Indian 4.51
4 South_Central_Asian 2.44
5 European_Hunters_Gatherers 2.12


Finished reading population data. 620 populations found.
23 components mode.

--------------------------------

Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Tubalar @ 58.145641
2 Khant @ 59.781586
3 Mansi @ 60.346027
4 Udmurd @ 67.725456
5 Ket @ 68.638206
6 Selkup @ 69.783745
7 Hakas @ 73.969345
8 Bashkir @ 75.684319
9 Tatar-Siberian @ 77.050774
10 Mari @ 77.755081
11 Chuvash @ 79.401367
12 Saami @ 80.591766
13 Tajik_Pomiri_Shugnan @ 81.109665
14 Chuvashs @ 81.114220
15 Turkmen_Afghan @ 81.119324
16 Altaian @ 81.865051
17 Tajik_Yagnobi @ 81.921104
18 Komi @ 82.281502
19 Uzbek @ 82.988045
20 Tatar @ 83.201286

 Отправлено: 08.10.14 16:48. Заголовок: Карачаевские и балка..

Карачаевские и балкарские аутосомные данные практически идентичны, разница в долях или еденицах % разных компонент.
Взял один из китов (Семенова).
Северо-Евразийская компонента у всех в районе 20 с хвостиком %, не знаю велико это или нет для Кавказа или для тюрок в сравнении с остальными народами.
Интересно, что реферанс данные по балкарцам в проектах на gedmatch какие-то странные, даже наши из проекта балкарские гаплотипы от них далеки (как и от меня, думал это из-за того, что я турок), а кумыки ближе всего (и мне тоже).

Kit F277523

Dodecad K12b Oracle results

Admix Results (sorted):

# Population Percent
1 Caucasus 44.02
2 North_European 20.37
3 Gedrosia 17.69
4 Atlantic_Med 6.06
5 Southwest_Asian 4.07
6 East_Asian 4
7 Siberian 3.52
8 South_Asian 0.27


MDLP K23b Oracle results:

Admix Results (sorted):

# Population Percent
1 Caucasian 44.24
2 South_Central_Asian 18.26
3 European_Hunters_Gatherers 13.49
4 Ancestral_Altaic 5.88
5 European_Early_Farmers 4.54
6 Near_East 2.84
7 Tungus-Altaic 2.38
8 Amerindian 1.78
9 North_African 1.65
10 East_Siberian 1.05
11 South_East_Asian 0.88
12 South_Indian 0.85
13 Melano_Polynesian 0.81
14 Austronesian 0.73
15 Paleo_Siberian 0.35
16 Arctic 0.16
17 Australoid 0.1

 Отправлено: 08.10.14 18:25. Заголовок: F999902 Altay Neande..

F999902 Altay Neandertal
F999906 Paleo Eskimo - BC 2000

 Отправлено: 08.10.14 19:23. Заголовок: Мой вопрос проигнори..

Мой вопрос проигнорировали, не заметили, или я все таки неверно его сформулировал?

 Отправлено: 08.10.14 19:45. Заголовок: Ходжа На gedmatch.c..

Ходжа
На gedmatch.com регистрируешься, из FTDNA экспортируешь raw data, далее загружаешь на свой аккаунт в gedmatch.com.
Там есть меню Admixture (Oracle) нажав на него увидишь список проектов выбирай любые, укажи номер своего кита, как правило это буква F далее номер твоего кита в ФТДНА.
Или более простой способ:
Ты ранее регистрировался на gedmatch.com? Если да, то скинь номер своего кита, я тебе скину примеси из нескольких проектов.
Если нет, то могу загрузить тебе твои row data на gedmatch (скинь его на почту) например или кто-нибудь тут из участников на чей обычно все регистрируете.

 Отправлено: 08.10.14 21:26. Заголовок: Biberd пишет: Кстат..

Biberd пишет:

цитата:

Кстати, надо бы Атабиевых протестировать.

Мы с Муратом поймали уже одного Атабиева (холамского) так что скоро увидим результаты.

А также наши Холамо-Безенгийские рода: Султановы, Бозиевы, Хочуевы, Чочаевы, Ольмезовы, Геляховы, Додуевы, Алиевы, Гаевы тоже протестировались.

 Отправлено: 08.10.14 22:12. Заголовок: Гергокова Лейля пише..

Гергокова Лейля пишет:

цитата:

Мы с Муратом поймали уже одного Атабиева (холамского) так что скоро увидим результаты.

Было бы интересно сравнить малкарского и холамо-безенгийского Атабиевых.

Гергокова Лейля пишет:

цитата:

А также наши Холамо-Безенгийские рода: Султановы, Бозиевы, Хочуевы, Чочаевы, Ольмезовы, Геляховы, Додуевы, Алиевы, Гаевы тоже протестировались.

Бабаевы (Къууанча вспомнил!) - холамцы?

 Отправлено: 08.10.14 23:03. Заголовок: Альберт да, Бабаевы ..

Альберт да, Бабаевы из Усхура. Их там около 20 семей было.

 Отправлено: 08.10.14 23:07. Заголовок: "А также наши Хо..

"А также наши Холамо-Безенгийские рода: Султановы, Бозиевы, Хочуевы, Чочаевы, Ольмезовы, Геляховы, Додуевы, Алиевы, Гаевы тоже протестировались"...

А где тестировались и где их результаты (будут)?