Отправлено: 23.09.14 23:57. Заголовок: Расхождения по отнесению к подветвям

Итак момент истины , первое расхождение.

Проект R1a отнес гаплотип астурийца B5513 к подветви Y934 (у Рожанского эта подветвь называется Bashkir, у нас Wusun).

https://www.familytreedna.com/public/R1a/default.aspx?section=yresults

См. стр. 6.



А на мой взгляд, астуриец относится к подветви FGC10232.


Кто прав, а кто ошибься скоро узнаем.

Уверен на все 100% подветвь астурийца относится к FGC10232.

 Отправлено: 24.09.14 10:22. Заголовок: Amigo пишет: Проект..

Amigo пишет:

цитата:

Проект R1a отнес гаплотип астурийца B5513 к подветви Y934 (у Рожанского эта подветвь называется Bashkir, у нас Wusun).

Если у админов проекта R1a есть ВАМ - файлы астурийца, башкир и индийцев, то вряд ли можно назвать ошибкой обнаруженный у астурийца снип Y934.
Скорее всего FGC10232 частный снип ветки астурийца. Местоположение снипа FGC10232 должно быть под Y934.

 Отправлено: 24.09.14 11:38. Заголовок: . ...>Z93>Z9..

https://www.familytreedna.com/public/R1a/default.aspx?section=yresults

. ...>Z93>Z94>Z2124>Z2125>Z2123-A>YP449>YP450(?)-B Karachay cluster (Big Y under lab procedure)
291797 Akbaev, Karachay Russian Federation R-M512
326188 Botash, Kart-Jurt Russian Federation R-M459
240222 Mustafa-Hadji Botash, b. 1815 and d. 1935 Russian Federation R-M459
306446 Aslan Hadji,gf of İ.Akbaev,Chokuna Efendi,Karachay Russian Federation R-M512

9. ...>Z93>Z94>Z2124>Z2125>Z2123-A>YP449>YP450(?)-B-y (more STRs and/or YP450 test needed)
309722 Kasay, Karachay
Скоро наверно увидим Big-Y Акбаева.

 Отправлено: 24.09.14 12:41. Заголовок: Скорее всего, у асту..

Скорее всего, у астурийца участок с Y934 не был прочитан "БигМаком". Например, у Коджакова и Темирбулатова так.

Однако Yfull нашли 19 снипов, характерных для ветви Bashkir-1, и один из этих снипов (Y5992) оказался в плюсе и у астурийца.





Соответственно, Y934 у него тоже в плюсе.

 Отправлено: 24.09.14 12:52. Заголовок: Atly пишет: 309722 ..

Atly пишет:

цитата:

309722 Kasay, Karachay

Ожидание результата Акбаева "немного" утомило, и я заказал YP450 для Касаева. Оказался в минусе снип.

 Отправлено: 24.09.14 14:29. Заголовок: Эсен пишет: Ожидани..

Эсен пишет:

цитата:

Ожидание результата Акбаева "немного" утомило, и я заказал YP450 для Касаева. Оказался в минусе снип.

По результату Созинова мы уже знаем, что YP450 "молодой" снип.
Но какие есть основания у админов проекта R1a считать что у Касаева снип YP449 в плюсе, или FTDNA в научных интересах
делают более глубокий анализ и результаты становятся известными в определенных кругах, в частности у админов проекта R1a?

 Отправлено: 24.09.14 15:59. Заголовок: Atly пишет: или FTD..

Atly пишет:

цитата:

или FTDNA в научных интересах делают более глубокий анализ и результаты становятся известными в определенных кругах, в частности у админов проекта R1a?

Да нет, просто админы бегут впереди паровоза.

 Отправлено: 24.09.14 16:05. Заголовок: Эсен пишет: Ожидани..

Эсен пишет:

цитата:

Ожидание результата Акбаева "немного" утомило, и я заказал YP450 для Касаева. Оказался в минусе снип.

У кого-нибудь из наших есть этот снип в плюсе?

 Отправлено: 24.09.14 16:11. Заголовок: Темирбулатов и Коджа..

Темирбулатов и Коджаков. Ну и у бий-кластера тоже 100% будет.

Насчет Катчиево-Батдыевского кластера - нет уверенности. Возможно, и минус будет. Скоро узнаем.

 Отправлено: 24.09.14 16:31. Заголовок: Эсен пишет: Насчет ..

Эсен пишет:

цитата:

Насчет Катчиево-Батдыевского кластера - нет уверенности. Возможно, и минус будет. Скоро узнаем.

Дней через 40, вроде как, должны узнать.

 Отправлено: 24.09.14 18:10. Заголовок: Эсен пишет: Да нет,..

Эсен пишет:

цитата:

Да нет, просто админы бегут впереди паровоза.

Очень смело, для Касаевских 12 маркеров.

 Отправлено: 24.09.14 19:33. Заголовок: FGC10232 и Y5992 - э..

FGC10232 и Y5992 - это 2 названия одного снипа
http://eng.molgen.org/viewtopic.php?p=22256#p22256

 Отправлено: 26.09.14 21:17. Заголовок: Эсеныч спасибо! Эс..

Эсеныч спасибо!

Эсен пишет:

цитата:

FGC10232 и Y5992 - это 2 названия одного снипа http://eng.molgen.org/viewtopic.php?p=22256#p22256

Ок понял. Просто не знал позицию снипа Y5992, оказывается Y5992 это второе название снипа FGC10232.

 Отправлено: 26.09.14 21:20. Заголовок: Atly пишет: Если у ..

Atly пишет:

цитата:

Если у админов проекта R1a есть ВАМ - файлы астурийца, башкир и индийцев, то вряд ли можно назвать ошибкой обнаруженный у астурийца снип Y934.

У меня есть Бам-файл астурийца и скоро на все 100% скажу есть ли снип Y934 у астурийца или нет, списался со спецами за консультацией по поводу бама астурийца.

У меня нет ни бам-файлов, ни биг-игреков - башкирских и индийских Y934, чтобы сравнить их с астурийцем FGC10232.

 Отправлено: 26.09.14 21:29. Заголовок: Эсен пишет: Скорее ..

Эсен пишет:

цитата:

Скорее всего, у астурийца участок с Y934 не был прочитан "БигМаком". Например, у Коджакова и Темирбулатова так.

Самостоятельно я смотрел биг-игрек астурийца и не нашёл у него снипа Y934.
Скоро, после консультации с другими этногеномистами - дам 100% ответ есть ли у астурийца Y934 или нет.

Если по баму у астурийца Y934 всё таки не будет - то возможна ваша версия, либо то что FGC10232 древнее чем снип Y934.

Но самое главное Эсен, состоит в следующем.

Семаргл снип FGC10232 даёт и башкирам Y934. Поскольку у меня нет данных по Биг-Игреку башкирских Y934, я не могу 100% сказать - есть ли снип FGC10232 у башкирских Y934, или этого снипа у башкир Y934 - нет.

Т.к. исходя из схемы Семаргла у подветви Wusun (она же подветвь Bashkir - по классификации И.Рожанского) - снипы Y934+, FGC10232+
а у астурийца если будет Y934-, и когда мы точно знаем что FGC10232 в плюсе у него, то получится астуриец Y934-, FGC10232+. То есть FGC10232 получится либо старше Y934, либо мы имеем в снипе Y934 - возвратную мутацию.

 Отправлено: 26.09.14 22:12. Заголовок: Amigo пишет: У меня..

Amigo пишет:

цитата:

У меня нет ни бам-файлов, ни биг-игреков - башкирских и индийских Y934, чтобы сравнить их с астурийцем FGC10232.

Индийские есть в открытом доступе в Интенете

Amigo пишет:

цитата:

я не могу 100% сказать - есть ли снип FGC10232 у башкирских Y934

Так его fullgenomes у Каримова и нашли. Также он в плюсе у YF02105.

Amigo пишет:

цитата:

То есть FGC10232 получится либо старше Y934

Как такое возможно, если у других Y934 он не встречается?

 Отправлено: 26.09.14 22:27. Заголовок: Эсен пишет: То есть..

Эсен пишет:

цитата:

То есть FGC10232 получится либо старше Y934 - Как такое возможно, если у других Y934 он не встречается?

Ок. Тогда получается, что Y934 действительно старше FGC10232, но я Y934 - не нашёл у астурийца. Поэтому всё равно проконсультируюсь и попрошу ещё других этногеномистов - найдут ли они снип Y934 по баму у астурийца или нет. Хочу проверить до конца.

Эсен пишет:

цитата:

Amigo пишет:  цитата: я не могу 100% сказать - есть ли снип FGC10232 у башкирских Y934. Конец цитаты. Так его fullgenomes у Каримова и нашли. Также он в плюсе у YF02105 (кит 285633).

Спасибо. Раз так, то значит я ошибься и астуриец действительно из подветви Wusun, а не из самостоятельной подветви.

Пойду объединю тему с астурийцем на Родстве.ру с темой о подветви Y934.

Получается так на самом деле выглядит ситуация:

B5513, Spain, Asturias,
Z2123+, FGC10232+, Y2632-, Y934+, CTS1806-

209978, Sura, Bashkir
Z2123+, FGC10232-, Y2632+, Y934-, CTS1806-

152829, Yansait-Suun, Bashkir
Z2123+, FGC10232+, Y2632-, Y934+, CTS1806-

290827, Kodzhakov, Karachay
Z2123+, FGC10232-, Y2632-, Y934-, CTS1806+

 Отправлено: 27.09.14 21:04. Заголовок: Ответ. В бам-файле ..

Ответ.

В бам-файле астурийца участок где есть мутация Y934 - не секвинирован, поэтому эту мутацию не удалось найти в его биг-игреке. Или другими словами участок хромосомы где есть мутация Y934 - у астурийца не проверяли секвинатором в ФТДНА. Поэтому ищи - не ищи, мутацию Y934 в биг-игреке астурийца - не найти, т.к. там просто не проверяли.

Как был сделан вывод, что Y934 всё-таки есть у астурийца: -

Поскольку FGC10232 нижестоящий субклад от Y934, и FGC10232 найден у астурийца - то следовательно у астурийца есть также мутация Y934.

Вывод: Астуриец B5513 имеет снипы Y934+, FGC10232+.