Автор | Сообщение |
Amigo
|
| |
Сообщение: 1867
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 08.06.14 19:11. Заголовок: R1a+CTS1806 карачаевcкий первый снип из субклада Z2123, и другие
Ну чтож потихоньку начнем обнародовать данные Биг-Игрека. Итак обнаружен первый карачаевский снип из субклада Z2123. Это снип CTS1806. Все снипы будут даваться в формате FTDNA: На сегодня из туранских подветвей субклада Z2123, тест Биг-Игрек в ФТДНА пока прошли только четыре гаплотипа: 1) 209978 Sura Bashkir SNP,"","CTS1806","No(-) 2) 290827 Kodzhakov Karachay SNP,"","CTS1806","Yes(+) 3) 246666 Hiun Bashkir SNP,"","CTS1806","No(-) 4) 246808 Suyun Bashkir SNP,"","CTS1806","No(-) Итак, ни у одного из приведенных ваше башкирских гаплотипов, не оказалось снипа, которые есть у карачаевца Коджакова. Вот только не знаю CTS1806 приватный снип у 290827, или это снип будет характерен и другим карачаевцам. Т.е. возраст этого снипа - пока неизвестен. Поздравляю карачаевцев с первым их снипом , который есть в формате FTDNA! Это значит праймеры от этого снипа есть в ФТДНА. К какому из 17 снипов 290827-го, обнаруженных компанией yfull.com соответствует фтднашный СTS1806 - не знаю, возможно СТS1806 и есть тот самый пресловутый YP449-й, а возможно это и любой другой из 17 снипов, классифицированных компанией yfull.com у 290827.
|
|
|
Ответов - 300
, стр:
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
All
[только новые]
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2076
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 13.07.14 14:55. Заголовок: Эсен пишет: YP449 6..
Эсен пишет: цитата: | YP449 6796744 C G YP450 8700457 T C YP451 9807494 T C YP452 14064757 G A YP453 14091773 C T YP454 14342665 T A YP455 14778203 C T YP456 17198827 G A YP457 17239577 G C YP458 17688103 C G YP459 18750919 T A YP460 19128108 G C YP461 21401365 A G YP462 21468217 C T YP463 22726845 A G YP464 23075467 G C YP465 23203974 A G |
| Все они могут оказаться сугубо карачаевскими. Нужно вводить в ФТДНА снип CTS1806 (имхо).
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2077
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 13.07.14 14:59. Заголовок: Умар пишет: Было та..
Умар пишет: цитата: | Было такое мнение по другому снипу в подобной ситуации |
| Совершенно верно! В дальнейшем просто для гг. N1 дадут скажем имя CTS1806.1 А для Z2123-х CTS1806.2. Или наоборот. Но их точно разделят, чтобы не путать при построении деревьев гг. Если скажем ещё найдут такую же мутацию у гг. скажем М. То им дадут название CTS1806.3 Т.е. за кем закрепят названия CTS1806.1, CTS1806.2 и т.д. - пока не решили.
|
|
|
Atly
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 375
Зарегистрирован: 13.10.13
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 13.07.14 18:54. Заголовок: Amigo пишет: Астури..
Amigo пишет: цитата: | Астурийцев, и тунисские Z2123 нужно проверять на снип CTS1806, он эквивалентен снипу KMS1. |
| Я что-то пропустил? Астуриец вроде Big-Y заказывал, а тунисские это которые?
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2079
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 13.07.14 19:12. Заголовок: Да астуриец Биг-Игре..
Да астуриец Биг-Игрек заказал. А тунисские это те самые у которых Z96+. Семаргл пишет: цитата: | Z96 — делеция. Вероятно FTDNA создали неправильные праймеры (разница в стандартах обработки инделей) и у всех протестированных этот снип оказался в минусе. Возможен и другой вариант — NA20539 и NA20796 — близкие родственники, поэтому снип приватный. |
| У этих двух тунисцев, L342 в плюсе; Семаргл пишет: цитата: | Z96 найден у двух тунисцев, скорее всего он может быть ниже L342.2. Вероятно маркирует небольшую ветвь. |
| http://forum.molgen.org/index.php/topic,4352.msg156826.html#msg156826
|
|
|
Atly
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 376
Зарегистрирован: 13.10.13
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 13.07.14 19:44. Заголовок: Amigo пишет: А тун..
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2081
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 13.07.14 19:58. Заголовок: Atly пишет: из Тоск..
Atly пишет: Да нашёл. Спасибо
|
|
|
Atly
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 377
Зарегистрирован: 13.10.13
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 13.07.14 20:14. Заголовок: Amigo пишет: Да наш..
Amigo пишет: Не за что, Амиго.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2082
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 13.07.14 21:01. Заголовок: Атлы какие будут мыс..
Атлы какие будут мысли по поводу снипа CTS314? У Темирболата он в плюсе.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2083
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 13.07.14 21:25. Заголовок: Amigo пишет: Атлы к..
Amigo пишет: цитата: | Атлы какие будут мысли по поводу снипа CTS314? У Темирболата он в плюсе. |
| Да намутили они с инструментарием , это оказывается минус у них выдает. У Темирболата минус.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2084
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 13.07.14 21:27. Заголовок: Умар пишет: цитат..
Умар пишет: цитата: | цитата: Mr. Nail Tazetdinov 99 4 CTS1806 L871 Z2122 , Z2123 Тазетдинов вроде из субклада z2122, а тут у него все три снипа Если я правильно понял ,сравнение показывает ,что у вас различие по 4 известным снипам с Тазетдиновым . У вас CTS1806 и Z2123 в плюсе, а у Тазетдинова они в минусе ,а L871 Z2122 с плюсом. |
| Т.е. в одну колонку закинули и минусовые и плюсовые снипы У Наиля надо читать как -++-
|
|
|
Atly
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 379
Зарегистрирован: 13.10.13
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 13.07.14 21:45. Заголовок: Amigo пишет: Т.е. в..
Amigo пишет: цитата: | Т.е. в одну колонку закинули и минусовые и плюсовые снипы |
| И я попался на это . Там все несовпадающие снипы.
|
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2085
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 13.07.14 21:57. Заголовок: Atly пишет: И я поп..
Atly пишет: цитата: | И я попался на это . Там все несовпадающие снипы. |
| Ладно хоть в Новелс вариантс не начудили. Обрати внимание очень много схожих мутаций - это как история с L342.1 и L342.2. К примеру у Темирболата и у меня есть снип SUR96. 28804779 - положение этого снипа. Следовательно чтобы нас не путать у него SUR96.1 у меня SUR96.2. То есть у нас с ним одинако мутации шли, хотя у обоих этот снип - приватный. У тебя этого снипа - нет.
|
|
|
Atly
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 380
Зарегистрирован: 13.10.13
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 14.07.14 08:21. Заголовок: Amigo пишет: У т..
Amigo пишет: цитата: | У тебя этого снипа - нет. |
| Вроде одинаково ChrY позиции: 28804779 (+strand) Консенсус аллеля: T Ссылка аллеля: В ChrY позиции: 28804779 (+strand) Консенсус аллеля: T Ссылка аллеля: В
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2104
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 14.07.14 09:47. Заголовок: Да. У тебя кстати ..
Да. У тебя кстати тоже есть подобного рода приватные снипы.
|
|
|
Atly
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 382
Зарегистрирован: 13.10.13
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 14.07.14 11:02. Заголовок: Amigo пишет: У тебя..
Amigo пишет: цитата: | У тебя кстати тоже есть подобного рода приватные снипы. |
| У меня их 46, у Темирбулатова 28, но имеет смысл сравнивать их внутри одной ветви.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2105
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 14.07.14 11:09. Заголовок: Atly пишет: У меня ..
Atly пишет: цитата: | У меня их 46, у Темирбулатова 28, но имеет смысл сравнивать их внутри одной ветви. |
| Внутри моей ветки снипа SUR96 нет ни у кого. Как и у тебя нет этого снипа. SUR96 есть только у меня и Темирболата. Вообщем история такая же как и с L342. Только тут это приватный снип, поэтому во избежание путаницы у Темирболата SUR96.1, а у меня SUR96.2
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2123
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 14.07.14 21:09. Заголовок: Странно, а почему не..
Странно, а почему некоторым больше снипов находят? От чего это интересно зависит? Ты вот Атлы пишешь, что у тебя больше снипов нашли чем у Темирболата.
|
|
|
Atly
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 383
Зарегистрирован: 13.10.13
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 15.07.14 07:39. Заголовок: Amigo пишет: Ты вот..
Amigo пишет: цитата: | Ты вот Атлы пишешь, что у тебя больше снипов нашли чем у Темирболата. |
| Все просто, из ветки z2123 yp450 я оказался первым заказавших Big-Y, поэтому и снипов больше. То есть исследование "нового" образца проводиться более тщательно.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2139
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 15.07.14 12:36. Заголовок: Атлы там другая прич..
Атлы там другая причина: Из нашего клана Биг Игрек сдавал вторым. У меня больше всего нашли снипов, хотя у того кто первый сдавал - у него меньше. Я вот думаю, не причина ли в том, что у некоторых людей больше мутаций происходит. Скажем у тебя и у меня их было больше. Ведь мутация снп - происходит 1-1,5 поколение. Если скажем у них раз в 1,5 поколения, то у нас раз в 1 поколение. Может причина в этом? Уточни если что у своих знакомых этногеномистов этот вопрос, почему у тебя снп больше нашли чем у других, какая причина на самом деле?
|
|
|
Atly
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 385
Зарегистрирован: 13.10.13
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 15.07.14 13:17. Заголовок: Amigo пишет: Я вот ..
Amigo пишет: цитата: | Я вот думаю, не причина ли в том, что у некоторых людей больше мутаций происходит. Скажем у тебя и у меня их было больше. |
| Альберт заказал Y-Full., думаю снипов у него будет больше чем у нас, не потому что у него больше мутаций, а из-за более глубокого исследования. В нашем случае это вопрос экономии средств (людских и пр.), вместо того чтобы глубже исследовать один образец, выгодно просмотреть наспех два образца. Денег они больше заработают, а претензию выставить мы не сможем.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2149
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 15.07.14 15:10. Заголовок: Эсен пишет: Провери..
Эсен пишет: цитата: | Проверил поочередно 17 снипов в новом инструменте "Big Y Matches" - у вашего клана ВСЕ 17 отсутствуют. |
| У нашего клана да. Ты прав. Но Все 17 снипов эти возможно только у карачаевцев будут встречаться. Поэтому Летта, Гергоковых, астурийца нужно проверять на CTS1806/KMS1. У астурийца Биг-Игрек - с нетерпением жду его матчей. После получения результатов Биг-Игрека у кандры-елан в матчах появятся результаты, и можно будет узнать какие из 17 карачаевских снипов совпадают с кандры-еланами.
|
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2150
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 15.07.14 15:30. Заголовок: Карачаевцы появились..
|
|
|
Turk
|
| moderator
|
Сообщение: 1631
Зарегистрирован: 04.08.09
Откуда: Turkey
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 15.07.14 15:38. Заголовок: Amigo a кем в основн..
Amigo a кем в основном представлены YP413?
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2151
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 15.07.14 16:01. Заголовок: Turk пишет: Amigo a..
Turk пишет: цитата: | Amigo a кем в основном представлены YP413? |
| Индоариями из штатов Пенджаб и Лахор. YP413 брат Z2123-го. P.S. Как видим, по данным генетики индоиранские Z2123 близки туранским Z2123. Все остальные стоят ещё дальше. У индоиранцев также есть субклад L657.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2263
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
1
|
|
Отправлено: 17.08.14 10:55. Заголовок: Атлы и Альберт спаси..
Атлы и Альберт спасибо что предупредили, чтобы не торопился со статьей о Биг Игрек - я чуть ошибки не наделал , только сейчас разобрался и освоил фильтр снипов, и понял что часть т.н. "приватных" снипов это мусор и остатки шума - то есть эти мусорные снипы не являются на самом деле приватными.
|
|
|
Эсен
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 1677
Зарегистрирован: 20.05.10
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 26.08.14 01:45. Заголовок: Amigo пишет: Но Все..
Amigo пишет: цитата: | Но Все 17 снипов эти возможно только у карачаевцев будут встречаться. |
| А для CTS1806 ты такой возможности не оставляешь? Чем он лучше на данный момент того же YP450? Почему именно его нужно проверять у Летта и других? цитата: | У астурийца Биг-Игрек - с нетерпением жду его матчей. |
| Мне кажется, будет изолированная подветвь Z2123. Уж очень он далек от всех на 111 маркерах.
|
|
|
Эсен
|
| постоянный участник
|
Сообщение: 1688
Зарегистрирован: 20.05.10
Репутация:
3
|
|
Отправлено: 28.08.14 02:21. Заголовок: Готовы результаты Bi..
Готовы результаты Big Y для Созинова (297806). Русский. Корни с севера современной Нижегородской области. Проверил его на «карачаевские» снипы. Те, что выделены зеленым - в плюсе, по другим - нет данных. Т.е. отрицательных не обнаружил. CTS1806 YP449 YP450 н/д YP451 YP452 YP453 н/д YP454 YP455 YP456 YP457 н/д YP458 YP459 YP460 YP461 YP462 н/д YP463 YP464 YP465 н/д Y4127 н/д Y4128 Y4129 н/д Y4130 н/д Y4131 н/д Собственно, я ожидал такого результата ввиду того, что его самый близкий гаплотип - Бостановский. 12 шагов на 67-ми маркерах. А также у Созинова уже был подтвержден Z2123.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2304
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
2
|
|
Отправлено: 28.08.14 08:28. Заголовок: Эсен пишет: CTS1806..
н/д = нет данных. Эсен пишет: цитата: | CTS1806 YP449 YP451 YP452 YP454 YP455 YP456 YP458 YP459 YP460 YP461 YP463 YP464 Y4128 |
| Какая интересная новость! Остались из карачаевских снипов, только эти у Созинова.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2305
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
2
|
|
Отправлено: 28.08.14 09:00. Заголовок: Эсен пишет: А для..
Эсен пишет: цитата: | А для CTS1806 ты такой возможности не оставляешь? Чем он лучше на данный момент того же YP450? Почему именно его нужно проверять у Летта и других? |
| Убедил. Согласен. Ждем результата тогда у Акбаева, Катчиева и астурийца, посмотрим какие из карачаевских снипов останутся у них. Но ставка моя прежняя, CTS1806 будет одним из самых древних из карачаевских. Время покажет - ошибался я или нет.
|
|
|
Amigo
|
| |
Сообщение: 2306
Зарегистрирован: 06.06.13
Откуда: Bashkortostan, Ufa
Репутация:
2
|
|
Отправлено: 28.08.14 09:19. Заголовок: Эсен пишет: А для C..
Эсен пишет: цитата: | А для CTS1806 ты такой возможности не оставляешь? Чем он лучше на данный момент того же YP450? |
| Кстати проверил на фильтре, снипа YP450 у Созинова нет.
|
|
|
Ответов - 300
, стр:
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
All
[только новые]
|
|